アノテーション情報

 
  AceGene ID : AceGene® のスポットを一意識別するIDです。

  >> Basic Information
 搭載 Oligo 設計時の情報が記されています。
  >> Hybridization Candidate Information
 Oligo 配列より、BLAST(相同性検索)を行った結果が記されています。
  >> Representative Hybridization Candidate Gene Information
 BLAST検索を行った結果決定した、代表 Entrez Gene ID に付随するアノテーション情報を表示しています。
  >> Gene Ontology Information
 代表 Entrez Gene ID に付随するGene Ontology 情報を表示しています。
  >> External DB
 日本発のデータベース公式サイトへのリンクです。
 
 Basic Information
 搭載 Oligo 設計時の情報が記されています。
MWG Description 設計時の遺伝子 Description 情報です。
MWG CDS ID AceGeneのプローブを一意に識別するID
Probe ID 相同性をもっている配列から引き当てたGene IDです。
Probe Kind AceGene プローブタイプを表します。Positive、Negative、QC、No Probe、Normalの4種類があります。
 Hybridization Candidate Information
 Oligo 配列より、BLAST(相同性検索)を行った結果が記されています。
DB Source 相同性検索を行った公共データベースの名です。
Sequence ID Blastでヒットした配列のIDです。このIDは各データベースに準じたIDになります。
Gene ID Sequence ID に対応した Enterz Gene IDです。
Gene Name Entrez GeneのOfficial Nameです
 Representative Hybridization Candidate Gene Information
 BLAST検索を行った結果決定した、代表 Entrez Gene ID に付随するアノテーション情報を表示しています。

※2008/1/7現在、KEGG Pathwayの項目は削除されております。
Gene ID 代表 Entrez Gene ID です。
Entrez Gene ID でリンクするDBTSSへのリンクアイコンです。
Entrez Gene ID でリンクするJSNPへのリンクアイコンです。
Symbol 遺伝子Symbolです。
Alias Symbol 遺伝子 Symbol の別名です。
Gene Name Entrez GeneのOfficial Nameです。
Location ゲノム上の位置です。
Function Summary 機能概要です。
Phenotype 遺伝子が関連している表現型です。
UniGene ID UniGeneのIDです。
Entrez Gene ID でリンクするBodyMap-Xsへのリンクアイコンです。
HomoloGene ID HomoloGeneのIDです。
Protein Name タンパク質名です。
Alias Protein Name タンパク質の別名です。
IPI ID 該当タンパクのIPI IDです。
Reactome Pathway Reactome Pathway名称です。
Motif モチーフ情報です。
EC Enzyme Codeです。
 Gene Ontology Information
 代表 Entrez Gene ID に対応する Gene Ontology を表記しています。
Molecular FunctionCellular ComponentBiological Processの3つのPrinciplesについて、
TermsSynonymsLineageを表記しています。
Molecular Function 遺伝子座から産生されるタンパク質の分子機能が記述されています。
Cellular Component 生体機能に関して記述されています。
Biological Process 細胞内構造、局在、高分子複合体に関する情報が記述されています。
Terms 代表 Entrez Gene ID に対する Term 情報です。
Synonyms 代表 Entrez Gene ID に対する Synonym 情報です。
Lineage 代表 Entrez Gene ID に対する Lineage 情報です。
 External DB
 日本発のデータベースとのリンクを表記しています。

※2008/1/7現在、KEGGの項目は削除されております。
DataBase Name 日本発のデータベース公式サイト名を表記しています。
BodyMap-Xs Unigene ID でリンクする BodyMap-Xs へのリンクです。
JSNP Entrez Gene ID でリンクする Japanese Single Nucleotide Polymorphisms へのリンクです。
DBTSS Entrez Gene ID でリンクする DataBase of Transcriptional Start Sites へのリンクです。
全長cDNA Entrez Gene ID でリンクする完全長 cDNA が存在する場合、NCBI GenBank へのリンクします。
H-InvDB H-InvDBへのリンクです。
Links 各データベースへのリンクです。
Connected by 各データベースとのリンクに使用したIDです。